吴昌时是在吏部衙门公房被锦衣卫直接带走的，当着吏部一众官吏的面。紧接着，吴昌时京中的宅第也被查封。

吴昌时被锦衣卫抓走后，立即被关入了北镇抚司诏狱之中。

周延儒听到这个消息后，立即慌神了。他亲自过问此案，可锦衣卫指挥使刘侨丝毫不给他面子。

刘侨亲自坐镇诏狱审讯吴昌时，仅半天，吴昌时就熬不过锦衣卫的刑具，全盘供认，在罪状上画押签字。

刘侨将供状呈交皇帝