帝论功行赏。黄来福斩首甚众，又斩其巨魁，依功应该升为总兵，不过内阁首辅王家屏认为，黄来福一年之间从守备升到总兵，升迁过速，怕是与国非富。万历帝认为很有道理，黄来福现在还不到二十岁，如果就升为总兵，确实是升得太快了。万历时官运最好的武将李如松，也不过34岁才升为总兵，己经被人议论年纪轻轻，就身居高位，于国非福。

最后擢升黄来福为副总兵，从二品，平时驻防五寨卫，冬移防老营堡，又照应偏关的安全