不过即便天将放明，史可法仍然还没有睡下，以南京兵部尚书的身份驻中都的他，负责督师中都等地的守备，去年东虏入寇时，还是户部右侍郎兼右佥都御史，接替朱大典总管漕运，驻徐州守备防止东虏南下，不过最后东虏止步于徐州北数百里外。

随后，他就调任南京兵部尚书，参赞机密政务，因为深知军队久不训练，没有战斗力，史可法上奏八条改革意见。但不曾想，这八条改革意见还没有回复，这边东虏又一次入寇中原了