在南海舰队进攻高雄港口的时候，东海舰队已经拿下澎湖列岛继续向东面开进，在台南的嘉义县发起了登陆作战。

嘉义县位于台南府的北面，拿下嘉义县就切断了李鸿章北上的道路。

东海舰队选择登陆的地方就在嘉义县的东石渔人码头，这里自康熙年间起就是台湾的大型港口，很适合大型军舰的停靠。

跟随李鸿章来台湾的淮军就有不少国安局安插的火狐，加上航空大队的高空侦查，在进攻