杨行舟知道自己与郭靖的理念多有不合，因此在襄阳城中见证杨过和郭芙成亲之后，便即离开襄阳，远赴少林盗经，尽量避免与郭靖夫妇长时间接触，免得发生矛盾。

在暗中发展明教弟子时，他也曾使人鼓动郭靖黄蓉加入自己的明教，只是郭靖夫妇对明教的成见有点深，一直都觉得明教中人行事偏于邪道，因此拒绝了明教弟子的好几次拉拢，甚至杨行舟主动出面想让郭靖夫妇加入明教，都被他们拒绝。