后，这里却几乎没有经过任何战事，因此武备松弛，另外卫所军大多分散在各地屯田，致令卫所形同虚设。

不过由于天津乃是漕运进京的中转站，并且长芦盐场亦建于此，因此这里吸引了大量的粮商盐商，这些商人的入住，令天津由一座军事重镇转变成一座商业之城。

天启二年，李邦华任天津巡抚，到任后巡视天津城曾说：‘城外商贾辐辏，骈填逼侧，城内却是屋瓦萧条，半为蒿莱。’可见天津卫荒废到何等程度。