南京是大明的留都，设立有六部、督察院、五军都督府、通政司、二十四监、翰林院、国子监等部院。

虽然相对的配置人员少一些，但在品阶上和北京一样。

且因为历史遗留的原因，南京六部虽然受北京统领，但实际上北京对南京掌控早已下降到了极点，否则整个南直隶也不至于糜烂到这种地步了。

贪官污吏极多，走后门的、花钱买的，银子开道，权利护航，官官相护，搜刮百姓，穷奢极欲。