说道阴阳眼的来历就不得不从宇宙始初说起，当时自然演化之道处于混沌中的太极之中，太极亦称太一，是种宇宙的原质。

后来经过了不知多久阴阳从太极中分化而出，轻清者为阳，上浮而为天;重浊者为阴，下凝而为地。就此天地形成，天地形成后阴阳二气互相吸引。

虽有盘古真人将其划分但仍不能完全隔离，阴阳二气混杂从而化育了万物。

万物中阴阳比较平均的就演化成了人，至阳者化为部分天神