三新东京市的废墟陆陆续续也都清理干净，进入了重建之中。伊恩住进了重建之后的公寓，在WILLE当中，担任“帕拉迪岛总代表”一职。碇真嗣和绫波丽，去了第二东京市，办理了一所寄宿中学的转学手续。他们作为EVA驾驶员的过去，只有少数人知道，从今以后，他们将重新开始他们的人生。经济方面不必担心，伊恩帮助他们讨回了“工钱”，把他们作为EVA驾驶员应得的收入，讨了回来。第二东京市离第三新东京并没有远到无法见面，