制为蓝本设立的，分设有十营，战兵一营统兵官为左副将，战兵二营、车兵三营为参将，车兵四营、城守五营为游击将军。

战兵六营统兵官为右副将，战兵七营、车兵八营为参将，车兵九营、城守十营为游击将军。

南征军最高统帅是征虏将军、总兵官、英国公张辅，其次是黔国公沐晟，之后便是副总兵姜毅、安远侯柳升、镇守中官马骐等人。

南征军除了常规十营之外，还有一些常规之外的编制。譬如朱高燨所在