如此又用了近两个月的时间，才将七十八万能用军马，匆匆新编成七支大军，剩余的近六十万人马，高一鸣也没打算放他们回去，而是将其中的七万身强力壮的人马编成了护漕卫，统一划归漕运总督，也就是史可法麾下，一面让他们帮助史可法整顿盐务，一面负责疏通大运河。

另外的五十多万人马，混编成了十支大军，在扬州整训了月余之后，就命令他们去两广、云贵等地驻扎，受这些地方巡抚节制，以补充他们人手不足的问题