郭之奇的祖上是福建莆田人，初迁居潮州，先是在海阳县登云都定居，后来到了郭诚时才迁到现在的揭阳县城东关的。那位郭诚往下传四代人就是郭之奇的父亲郭应试，其人做过州同知，生有八子，郭之奇排行老二，族中的兄弟便多有称其为二哥的。

算起来，郭家在揭阳已逾百年，在本县士林当中颇具影响力，即便在整个潮州也是小有名气的。当年郑成功、郑鸿逵和陈凯先后经营潮州，对郭家也是持着拉拢态度的。