广西布政使司梧州府，下辖九县一州，分别是苍梧、藤县、容县、岑溪、怀集、北流、博白、兴业、陆川九县，郁林一州。

朝廷原来比较固定的四大总督府，分别是蓟辽保定、宣大山西、陕西三边、两广总督。其中，两广总督府的治所就在梧州府。

朝廷设置两广总督府主要目的，就是应付此起彼伏的瑶族、苗族叛乱，扼制交趾、南越势力的扩张。

一直到嘉靖四十三年，两广总督府才迁往肇庆府。