刚从襄阳回到棘阳，杨佺期便收到了尚书省的公文，要求各州郡县赈济灾民，杨佺期召集众人商议。

晋设尚书、中书、门下三省共同处理朝政。尚书省掌管行政大权，设有吏部、祠部、度支、左民、都官、五兵等六部尚书（渡江后撤去都官，成为五部），最高长官尚书令；中书省总领百官，掌握部分的地方行政，最高长官中书令，官位在尚书令之下，权力在其之上；门下省参议国政大事，负责审查诏令，签署章奏，有封驳诏令、