在接手沈阳后，重新经营防线，可是没想到朝廷竟然红旗催战，要他出兵乘机彻底剿灭东虏，熊廷弼上奏不应，结果被罢免了官职，继而东林党以袁应泰任辽东经略，又出军费百万两，集兵六万，三路出师剿匪，结果再次大败，就连沈阳也得而复失。

这时候他们才又想起熊廷弼来，谁知道这回熊廷弼脾气发作，坚持不愿再去辽东这个火坑，除非内阁于他军政大权，不设巡抚掣肘，有临机独断之权，另外军费也得直接下拨到他手里，不经过