感国家灭亡、社稷倾覆，对兄长投靠异族，效力仇敌的行为极为痛恨，发誓“头不戴清朝天，脚不踏清朝地”，携母亲避居船上，泛江隐居，并不与其兄相见，体现了真正的洪门家风。

在顺治十六年（1659年），心力交瘁的洪承畴年老体衰、目疾加剧，第二年正月解任回京。

最令尴尬的是，洪承畴既受到明朝遗民的强烈排斥，却也没有真正被清朝接受。在入关之初，洪承畴建议满族权贵汉化，学习儒家礼仪。而汉化的满