只要有树叶飞舞的地方，火就会燃烧……

三年的时光悄然而逝，木叶村中的新一代也已茁壮成长，火之意志正由他们继承。然而，故事的主角、传说中的预言之子漩涡鸣人与恩师自来也才刚刚踏上归乡的旅程。

那一天，却有一场诡异的瘟疫，无声无息之间降临在了一座小镇上。

开始，居民并不以为意，认为只是一种普通的疾病，漠然置之。

直至后来，当患者袭击周围的人，啃食他们的血肉