苏丹后的政治路线与以前有很大不同。 在他之前奥斯曼帝国的数代君主,都把开疆扩土作为第一目标,但巴耶济德却把内部发展作为首要任务。为此他削弱了权臣德米舍梅的权利,加强中央集权,对税收制度进行了较大的修改,他力图平衡帝国内部各阶级的利益,缓解矛盾,以使帝国能够稳定的发展经济。在1495年,来自杰姆的威胁消除之后。巴耶济德对内部改革的力度更是加大,除了制度上的变革,他更希望建立一个完整的文化体