山南麓建立的吐鲁番王国又不断东侵，而世界航海业也在此时逐渐发达起来，东西方贸易交流和使节往来的通道，由陆地逐渐移向海洋，那往返穿梭于各大洋之间的巨舟大船，其行进速度、承载人货的数量，都远胜于骆驼百倍千倍，西域的陆上交通和边庭防务已渐渐失去原先举足轻重的意义。

因此，正德十一年，敦煌被吐鲁番占领，嘉靖三年，明王朝闭锁嘉峪关，将关西百姓迁徙关内，废弃了瓜沙二州，此后二百年敦煌旷无建置，成为“