公司派七艘军舰外加士兵九百人，第二次入侵澎湖，并封锁了漳州出海口。

他们上一次入侵澎湖，则是还在十八年前的万历三十二年，由舰队司令韦麻郎率舰队入侵澎湖，要求互市，遭到福建巡抚拒绝，并派都司沈有容到澎湖击退了荷兰人。

不甘心的荷兰人十八年后再次卷土重来，福建巡抚南居益亲自抵达金门，率领一万士兵，两百艘兵船，渡海收复澎湖。

经过七个月苦战，耗费军费十七万两，终于将荷兰人击